«Скрытая угроза» - самое начало легендарной саги. Мы попадаем в то самое время, когда рыцари-джедаи еще хранили мир и спокойствие в Галактике, а маленький мальчик Энакин Скайуокер еще не поддался влиянию темной стороны Силы, да и Император Палпатин был лишь амбициозным сенатором. Но темная Сила, готовая поглотить планеты и народы, пробудилась, и только древнее пророчество джедаев об избранном, который принесет равновесие в Силу, дает надежду в преддверии катастрофы.
Скрытая угроза нависла над Республикой, простоявшей не одну тысячу лет, но теперь погрязшей в пучине политических разногласий и интриг. Мастер-джедай Квай-Гон Джин и его ученик Оби-Ван Кеноби приходят на помощь королеве Амидале, которая стремиться спасти планету Набу от блокады алчной Торговой Федерации. Бегство с Набу приводит джедаев на песчаные просторы Татуина, где им суждена встреча с Энакином Скайуокером.